Repeats 8 1.0012.866

Данная программа позволяет быстро и легко находить несовершенные (в том числе, перекрывающиеся) прямые повторы, а также зеркально симметричные и палиндромные участки в последовательностях символов (или, как пример использования, пределах фрагментов нуклеиновых кислот и белков).

Разработчик:   Друца Алексей Валерьевич       другие программы → Лицензия:   Freeware Размер:   298K Язык:    ОС:   Windows Vista (?) Рейтинг:   0 /5 (0 голосов)

Данная программа позволяет быстро и легко находить несовершенные (в том числе, перекрывающиеся) прямые повторы, а также зеркально симметричные и палиндромные участки в последовательностях символов (или, как пример использования, пределах фрагментов нуклеиновых кислот и белков). Для этого: (а) осуществляется ввод анализируемой последовательности с клавиатуры или из файла (например, .txt); (б) задаются параметры для построения двумерной матрицы (количество несовпадений в пределах повтора и сдвиг рамки, минимальную длину ожидаемого структурного элемента); (в) на следующем этапе программа осуществляет «фильтрацию» - селекцию неслучайных достаточно протяженных повторов, допускающих пропуски и сдвиг рамки (на 1-2 нуклеотида), устраняя фоновые случайные совпадения отдельных звеньев; (г) вывод на экран результатов поиска с возможностью масштабирования матрицы и сохранения в отдельном файле; (д) протяженные участки, располагающиеся параллельно основной диагонали матрицы, соответствуют прямым повторам, а перпендикулярные основной диагонали – элементам зеркальной симметрии. Программа также позволяет находить в нуклеотидных последовательностях обращенные повторы (палиндромы), которые выглядят на матрице как параллельные или перпендикулярные основной диагонали кластеры точек, в зависимости от способа введения по оси Y не исходной, а комплементарной нуклеотидной последовательности.

 Скачать Repeats 8 1.0012.866

Программы разработчика

Альтернативные программы

Другие программы категории

Зодиак 2.51
Максим Горбач

Зодиак - c помощью этой программы вы много нового о себе узнаете.

I2R Computer - еженедельный сетевой журнал #3
Антон Дрейзин

I2R Computer - Электронный журнал о компьютерах, программах, Интернете.

Считалка калорий 1.4.58
Olga Lebedeva

Считалка калорий - программа поможет рассчитать пищевую и энергетическую ценность (калорийность) рациона.

Socionix 1.06
Oleksandr Liutyi

Socionix - Программа для тестирования типа личности (Тест института им.

Words 3.12
Soft-One.com

Words - это обучающая программа, помогающая учить иностранные слова, не затрачивая на это много времени.