Repeats 8 1.0012.866
Данная программа позволяет быстро и легко находить несовершенные (в том числе, перекрывающиеся) прямые повторы, а также зеркально симметричные и палиндромные участки в последовательностях символов (или, как пример использования, пределах фрагментов нуклеиновых кислот и белков).
|
Данная программа позволяет быстро и легко находить несовершенные (в том числе, перекрывающиеся) прямые повторы, а также зеркально симметричные и палиндромные участки в последовательностях символов (или, как пример использования, пределах фрагментов нуклеиновых кислот и белков). Для этого: (а) осуществляется ввод анализируемой последовательности с клавиатуры или из файла (например, .txt); (б) задаются параметры для построения двумерной матрицы (количество несовпадений в пределах повтора и сдвиг рамки, минимальную длину ожидаемого структурного элемента); (в) на следующем этапе программа осуществляет «фильтрацию» - селекцию неслучайных достаточно протяженных повторов, допускающих пропуски и сдвиг рамки (на 1-2 нуклеотида), устраняя фоновые случайные совпадения отдельных звеньев; (г) вывод на экран результатов поиска с возможностью масштабирования матрицы и сохранения в отдельном файле; (д) протяженные участки, располагающиеся параллельно основной диагонали матрицы, соответствуют прямым повторам, а перпендикулярные основной диагонали – элементам зеркальной симметрии. Программа также позволяет находить в нуклеотидных последовательностях обращенные повторы (палиндромы), которые выглядят на матрице как параллельные или перпендикулярные основной диагонали кластеры точек, в зависимости от способа введения по оси Y не исходной, а комплементарной нуклеотидной последовательности.
Программы разработчика
Альтернативные программы
Repeats 8 1.0012.866
Друца Алексей Валерьевич
Данная программа позволяет быстро и легко находить несовершенные (в том числе, перекрывающиеся) прямые повторы, а также зеркально симметричные и палиндромные участки в последовательностях символов (или, как пример использования, пределах фрагментов нуклеиновых кислот и белков).
Pic2Matrix 1.2.0.115
Исаенко Вадим Владимирович
Конвертер рисунков в код "Матрицы".
MacroWizard v1.0
Лившиц Вадим
Основной функцией MacroWizard является запись последовательности действий пользователя: движений мыши и ввода с клавиатуры.
RefKillRepeat5.52
AdApter
Поиск повторов в справочниках.
MatSolver v1.0 beta
Zaytsev Arkady
Программа для матричных вычислений.
CMatrix
Unknown
Показывает экран Матрицы.
Решалка Горнера v.1
Воронов Роман Александрович
Данная программа создана для проверки степени корня многочлена.
Pda.EXE v2.1
Lavrov
Программа позволяет находить делители заданного числа а также простые числа в указанном промежутке.
Поиск всяческих вещей в нумерации документов
Roman
Ищет дыры (пропуски) в нумерации документов, а также в последовательности нумерации.
Поиск решения системы линейных уравнений
Unknown
Простенькая, консольная программа поиска решения системы линейных алгебраических уравнений методом отражений.
Другие программы категории
Зодиак 2.51
Максим Горбач
Зодиак - c помощью этой программы вы много нового о себе узнаете.
I2R Computer - еженедельный сетевой журнал #3
Антон Дрейзин
I2R Computer - Электронный журнал о компьютерах, программах, Интернете.
Считалка калорий 1.4.58
Olga Lebedeva
Считалка калорий - программа поможет рассчитать пищевую и энергетическую ценность (калорийность) рациона.
Socionix 1.06
Oleksandr Liutyi
Socionix - Программа для тестирования типа личности (Тест института им.
Words 3.12
Soft-One.com
Words - это обучающая программа, помогающая учить иностранные слова, не затрачивая на это много времени.